| Pesantren: dari transformasi metodologi menuju demokratisasi institusi M Qomar Erlangga, 2002 | 682 | 2002 |
| Epistemologi pendidikan Islam: Dari metode rasional hingga metode kritik M Qomar Erlangga, 2005 | 438 | 2005 |
| Manajemen Pendidikan Islam: Strategi Baru Pengelolaan Lembaga Pendidikan Islam M Qomar Erlangga, 2007 | 224 | 2007 |
| NU" liberal": dari tradisionalisme ahlussunah ke universalisme Islam M Qomar Mizan, 2002 | 100 | 2002 |
| Epistemologi Pendidikan Islam M Qomar Jakarta: Erlangga, 2005 | 67 | 2005 |
| Kesadaran Pendidikan Sebuah Penentu Keberhasilan Pendidikan M Qomar Yogyakarta: Ar-Ruzz Media, 2012 | 55 | 2012 |
| Pesantren dari Transformasi Metodologi Menuju Demokratisasi Institusi Q Mujamil Jakarta: PT Gelora Aksara Pratama, 2005 | 55 | 2005 |
| Menggagas Pendidikan Islam M Qomar PT. Remaja Rosdakarya, 2014 | 41 | 2014 |
| Strategi Pendidikan Islam M Qomar Penerbit Erlangga, 2013 | 40 | 2013 |
| Pemikiran Islam Metodologis: Model Pemikiran Alternatif dalam Memajukan Peradaban Islam M Qomar Kalimedia, 2015 | 36 | 2015 |
| Dimensi manajemen pendidikan Islam M Qomar Emir, 2015 | 35 | 2015 |
| Fajar Baru Islam Indonesia M Qomar Mizan 1, 1-286, 2012 | 22 | 2012 |
| Meniti Jalan Pendidikan Islam M Qomar Yogyakarta: Pustaka Pelajar, 2003 | 18 | 2003 |
| Hingga Metode Kritik M Qomar, EPIDM Rasional Jakarta: Erlangga, 2005 | 17 | 2005 |
| Fajar baru Islam Indonesia?: kajian komprehensif atas arah sejarah dan dinamika intelektual Islam Nusantara M Qomar Mizan, 2012 | 12 | 2012 |
| Pesantren M Qomar Dari Transformasi Metodologi Menuju Demoratisasi Institusi, Jakarta: Erlangga, 2007 | 12 | 2007 |
| Islam Nusantara: Sebuah Alternatif Model Pemikiran, Pemahaman, dan Pengamalan Islam M Qomar EL HARAKAH (TERAKREDITASI) 17 (2), 198-217, 2016 | 8 | 2016 |
| Merintis kejayaan Islam kedua: merombak pemikiran dan mengembangkan aksi M Qomar Teras, 2012 | 6* | 2012 |
| Strategi Baru Pengelolaan Lembaga Pendidiakan Islam-Manajemen Pendidikan Islam M Qomar Surabaya: Erlangga, 2007 | 6 | 2007 |
| Ragam Identitas Islam Di Indonesia Dari Perspektif Kawasan M Qomar Epistemé: Jurnal Pengembangan Ilmu Keislaman 10 (2), 317-352, 2015 | 5 | 2015 |