| Character building N Naim Jogjakarta: Ar-Ruzz Media, 2012 | 1649 | 2012 |
| Pendidikan multikultural, konsep dan aplikasi N Naim Ar-Ruzz Media, 2017 | 927 | 2017 |
| Menjadi guru inspiratif: memberdayakan dan mengubah jalan hidup siswa N Naim Pustaka pelajar, 2016 | 907 | 2016 |
| Dasar-dasar komunikasi pendidikan N Naim Jogjakarta: Ar-Ruzz Media, 2011 | 395* | 2011 |
| Pengantar Studi Islam N Naim Yogyakarta: Teras, 2009 | 134 | 2009 |
| Rekonstruksi pendidikan nasional: membangun paradigma yang mencerahkan N Naim, K Aibak Teras, 2009 | 119 | 2009 |
| Islam dan Pluralisme Agama: Dinamika Perebutan Makna N Naim Aura Pustaka, 2015 | 113 | 2015 |
| Teologi kerukunan: mencari titik temu dalam keragaman N Naim Teras, 2011 | 90 | 2011 |
| Sejarah pemikiran hukum Islam N Naim Lembaga Kajian Agama dan Filsafat (eLKAF), 2006 | 57 | 2006 |
| Pengembangan Pendidikan Aswaja Sebagai Strategi Deradikalisasi N Naim Walisongo: Jurnal Penelitian Sosial Keagamaan 23 (1), 69-88, 2015 | 54 | 2015 |
| Abdurrahman Wahid: Universalisme Islam dan Toleransi N Naim Kalam 10 (2), 423-444, 2016 | 52 | 2016 |
| Optimalisasi Peran Pendidikan dalam Pengembangan Ilmu dan Pembentukan Karakter Bangsa N Naim Jogjakarta: Ar-Ruzz Media, 2012 | 49 | 2012 |
| Integration of" Madrasah Diniyah" Learning Systems for Strengthening Religious Moderation in Indonesian Universities. N Naim, A Aziz, T Teguh International Journal of Evaluation and Research in Education 11 (1), 108-119, 2022 | 31 | 2022 |
| Islam dan Pancasila: Rekonstruksi Pemikiran Nurcholish Madjid N Naim Epistemé: Jurnal Pengembangan Ilmu Keislaman 10 (2), 435-456, 2015 | 30 | 2015 |
| Kebangkitan Spiritualitas Masyarakat Modern N Naim Kalam 7 (2), 237-258, 2013 | 27 | 2013 |
| Mengembalikan Misi Pendidikan Sosial Dan Kebudayaan Pesantren N Naim Jurnal Pendidikan Islam 27 (3), 449-462, 2012 | 27 | 2012 |
| Islamophobia in education: perceptions on the use of veil/niqab in higher education HCA Kistoro, B Kartowagiran, E Latipah, N Naim, H Putranta, D Minggele Indonesian Journal of Islam and Muslim Societies 10 (2), 227-246, 2020 | 24 | 2020 |
| Membangun Toleransi dalam Masyarakat Majemuk, Telaah Pemikiran Nurcholish Madjid N Naim Harmoni 12 (2), 31-42, 2013 | 21 | 2013 |
| The actualization of liberal Indonesian multicultural thought in developing community harmonization N Naim, M Qomar Qudus International Journal Of Islamic Studies (Qijis) 9 (1), 141-174, 2021 | 18 | 2021 |
| Membangun Kerukunan Masyarakat Multikultural N Naim Harmoni 15 (1), 203-213, 2016 | 16 | 2016 |
